L’ancien Pont à transbordeur était implanté – on peut encore en voir les piles – à l’emplacement exact du pont Anne de Bretagne.
Le site recommandé pour le nouvel ouvrage est sur le même Bras de la Madeleine, à environ 700 mètres à l’aval et à 500 mètres en amont de la pointe de l’île, à l’est du Hangar à Bananes. Sur la rive droite ses accès seraient à l’ouest du bâtiment du Grand Port Maritime.